Doctoral Student in Environmental Bioengineering — ETH Zürich

Vollständige Beschreibung

Doktorandin im Environmental Bioengineering

100%, Zürich, befristet

Die Environmental Microfluidics Group von Prof. Roman Stocker am Institute of Environmental Engineering sucht einen dynamischen und motivierten Doktoranden mit einem technischen Hintergrund für ein Projekt, wie bakterielle Chemotaxis den Plasmidtransfer beschleunigt, einschließlich der Ausbreitung von Antibiotikaresistenzen. Die Stelle wird durch ein kürzlich gewährtes SNF-Stipendium finanziert, und das Projekt ist eine gemeinsame Anstrengung mit Prof. Jonasz Slomka an der Universität Warschau. Diese Position wird im Labor von Prof. Roman Stocker.

Projekthintergrund

Bakterielle Konjugation, der kontaktabhängige Transfer von Plasmiden zwischen Zellen, beschleunigt die bakterielle Evolution und ist ein wichtiger Weg für die Ausbreitung von Antibiotikaresistenzen in der Umwelt, was wiederum eine globale Gesundheitsbedrohung darstellt. Aquatische Umgebungen sind voll von mikroskaligen chemischen Hotspots wie der nährstoffreichen "Phykosphäre" um Phytoplankton und sinkende Meerespartikel, und chemotaktische Bakterien sind dafür bekannt, an diesen Orten schnell zu finden und sich anzusammeln. Dieses Projekt wird die Hypothese testen, dass diese Akkumulation die Ausbreitung von Plasmiden in der Umwelt fördert und zu einer innovativen Sichtweise der Rolle der Antibiotikaresistenz in der Natur beiträgt.

Das Projekt will untersuchen, wann, wo und wie stark diese Verbesserung in verschiedenen chemischen Hotspots, Flüssigkeitsflüssen und Bakterienstämmen wirkt und was sie für die Ausbreitung von Antibiotikaresistenzen unter Wasserbakterien bedeutet.

Stellenbeschreibung

Dies ist ein primär experimenteller PhD an der Schnittstelle von Technik und Mikrobiologie. Der Student wird:

• Entwerfen, bauen und charakterisieren Sie neue Instrumente, um bestehende Chemotaxis-Assays mit kontrollierten Schersystemen zu koppeln. Dazu gehören mechanisches Design, 3D-Druck, Steuerungssysteme und die Integration mit einem Fluoreszenzmikroskop.
• Durchführung von Chemotaxis- und Konjugationsexperimenten mit bakteriellen Spendern und Empfängern von Plasmiden und einer Reihe von Chemoattraktiva mit der Möglichkeit, fortschrittliche Techniken wie Durchflusszytometrie und Plasmidtransferquantifizierung auf Plattenleserbasis zu erlernen und anzuwenden.
• Bild und verfolgen Sie fluoreszenzmarkierte Bakterien und chemische Federn in Scherströmung und analysieren Sie die Daten mit quantitativen Bild- und Datenanalyse-Pipelines.
• Testen Sie klinisch relevante Bakterien und Süßwasserbakterien (z. B. Seebakterien), um das Potenzial für eine durch Chemotaxis bedingte Ausbreitung von Resistenzen in der Umwelt zu bewerten.
• Tragen Sie Daten zu mathematischen Modellen der Plasmidausbreitung bei.

Profil

Wir suchen einen praxisorientierten, erfahrenen und neugierigen Ingenieur, der gerne neue Werkzeuge baut und daran interessiert ist, mit ihnen grundlegende wissenschaftliche Fragen zu beantworten. Ideale Kandidaten haben einen MSc-Abschluss in Biotechnik, Maschinenbau, Mechatronik, Elektrotechnik, Umwelttechnik, Physik oder einer verwandten Disziplin und haben einige (nicht unbedingt alle) der folgenden Fähigkeiten:

• Praktische Erfahrung im Prototyping und in der Fertigung, zum Beispiel CAD, 3D-Druck, Bearbeitung (stark bevorzugt).
• Erfahrung mit Steuerungssystemen und Instrumenten, beispielsweise Motorsteuerung, Sensoren, Mikrocontroller und Automatisierungs- oder Datenerfassungscode (Python, MATLAB, LabVIEW oder ähnliches) (bevorzugt).
• Offenheit, um Erfahrungen im Labor für Mikrobiologie zu sammeln: Bakterienkulturen, Steriltechnik, Plattenleser und Durchflusszytometrie.
• Vertrautheit mit Mikroskopie, Bildanalyse, Strömungsmechanik oder Mikrofluidik (nützlich, aber nicht notwendig).
• fließend Englisch (mündlich und schriftlich), Begeisterung für die Arbeit in einem interdisziplinären und internationalen Team und der Antrieb, wissenschaftliche Exzellenz zu verfolgen (erforderlich).

Sie werden von Prof. Roman Stocker und von Mitgliedern seines Labors mit umfangreicher Erfahrung in Mikrobiologie, experimentellen Techniken und Umweltprozessen. Sie haben die Möglichkeit, in einer innovativen, schnelllebigen Forschungsumgebung zu arbeiten, mit Forschern aus vielen verschiedenen Disziplinen (Ingenieure, Physiker, Mikrobiologen, Ozeanographen, Chemiker, Mathematiker) zu interagieren, technische Erfahrungen über verschiedene Forschungsansätze zu sammeln und mit erstklassigen Mitarbeitern zu interagieren.

Wir bieten

Die ETH Zürich ist ein familienfreundlicher Arbeitgeber mit hervorragenden Arbeitsbedingungen. Freuen Sie sich auf ein spannendes Arbeitsumfeld, kulturelle Vielfalt und attraktive Angebote und Vorteile.

Wir legen Wert auf Vielfalt und Nachhaltigkeit

Im Einklang mit unseren Werten fördert die ETH Zürich eine inklusive Kultur. Wir fördern Chancengleichheit, schätzen Vielfalt und fördern ein Arbeits- und Lernumfeld, in dem die Rechte und die Würde aller unserer Mitarbeiter und Studenten respektiert werden. Besuchen Sie unsere Website für Chancengleichheit und Vielfalt, um herauszufinden, wie wir ein faires und offenes Umfeld gewährleisten, in dem jeder wachsen und gedeihen kann. Nachhaltigkeit ist für uns ein zentraler Wert – wir arbeiten konsequent auf eine klimaneutrale Zukunft hin.

Neugierig? Wir sind es auch.

Wir freuen uns auf Ihre Online-Bewerbung bis zum 15. Dezember 2026, einschließlich der folgenden Dokumente:

• Lebenslauf
• Anschreiben (maximal eine Seite, einschließlich kurzer Motivation, Forschungsinteressen und mögliches Startdatum)
• Vollständiges Transkript aus dem Grundstudium (Bachelor und Master, einschließlich Noten)
• Kopie der Master- oder Bachelorarbeit (PDF)
• Mindestens zwei Referenzbuchstaben

Weitere Informationen über The Stocker Lab finden Sie auf unserer Website. Fragen zur Position richten Sie bitte an Dr. Stefano Ugolini, [email protected] (keine Bewerbungen).

Anträge werden geprüft, sobald sie eingegangen sind.

Bitte beachten Sie, dass wir ausschließlich Bewerbungen annehmen, die über unser Online-Bewerbungsportal eingereicht werden. Bewerbungen per E-Mail oder Post werden nicht berücksichtigt.

Wir weisen darauf hin, dass die Vorauswahl durch die verantwortlichen Recruiter und nicht durch künstliche Intelligenz erfolgt.

Über die ETH Zürich

Die ETH Zürich ist eine der weltweit führenden Universitäten, die sich auf Wissenschaft und Technologie. Wir sind bekannt für unsere hervorragende Ausbildung, Spitzenforschung und direkter Wissenstransfer in die Gesellschaft. Über 30.000 Menschen aus mehr als 120 Ländern finden unsere Universität ein Ort zu sein, der unabhängiges Denken und eine Umwelt, die Exzellenz inspiriert. Im Herzen Europas gelegen, noch schmieden Verbindungen auf der ganzen Welt, arbeiten wir zusammen, um Lösungen für die globalen Herausforderungen von heute und morgen zu entwickeln.

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