Doctoral Student in Environmental Bioengineering — ETH Zürich

Description complète

Étudiant au doctorat en bioingénierie environnementale

100%, Zurich, durée déterminée

Le Groupe des microfluidiques environnementales du Prof. Roman Stocker à l'Institut d'ingénierie environnementale cherche un doctorant dynamique et motivé avec une formation en ingénierie pour un projet sur la façon dont la chimiotaxie bactérienne accélère le transfert de plasmide, y compris la propagation de la résistance aux antibiotiques. Le poste est financé par une subvention récemment accordée par la SNSF, et le projet est un effort conjoint avec Prof. Jonasz Slomka à l'Université de Varsovie. Ce poste sera basé dans le laboratoire du Prof. Roman Stocker.

Contexte du projet

La conjugaison bactérienne, le transfert de plasmides dépendant du contact entre les cellules, accélère l'évolution bactérienne et est une voie majeure pour la propagation de la résistance aux antibiotiques dans l'environnement, qui pose à son tour une menace pour la santé mondiale. Les milieux aquatiques regorgent de points chauds chimiques à microéchelle, comme la «phycosphère» riche en éléments nutritifs autour du phytoplancton et des particules marines qui coulent, et les bactéries chimiotactiques sont connues pour trouver et s'accumuler rapidement à ces endroits. Ce projet mettra à l'essai l'hypothèse que cette accumulation favorise la propagation du plasmide dans l'environnement, contribuant ainsi à une vision de pointe du rôle de la résistance aux antibiotiques dans la nature.

Le projet vise à étudier quand, où et dans quelle mesure cette amélioration fonctionne à travers différents points chauds chimiques, flux de fluides et souches bactériennes, et ce qu'elle signifie pour la propagation de la résistance aux antibiotiques parmi les bactéries aquatiques.

Description du poste

Il s'agit d'un doctorat principalement expérimental à l'interface de l'ingénierie et de la microbiologie. L'étudiant :

• Concevoir, construire et caractériser de nouveaux instruments pour coupler les essais chimiotaxis existants à des systèmes de cisaillement contrôlés. Cela inclut la conception mécanique, l'impression 3D, les systèmes de commande et l'intégration avec un microscope à fluorescence.
• Exécuter des expériences de chimiotaxie et de conjugaison avec des donneurs bactériens et des receveurs de plasmides ainsi qu'une gamme de chimio-attractants, avec l'occasion d'apprendre et d'utiliser des techniques avancées telles que la cytométrie en flux et la quantification par transfert de plasmides à base de plaques.
• Imager et suivre les bactéries fluorescentes et les panaches chimiques dans le flux de cisaillement, et analyser les données avec des pipelines quantitatifs d'analyse des images et des données.
• Tester les bactéries cliniquement pertinentes et les bactéries d'eau douce (p. ex., le lac) afin d'évaluer le potentiel de propagation de la résistance par chimiotaxis dans l'environnement.
• Contribuer aux données des modèles mathématiques de propagation du plasmide.

Profil

Nous sommes à la recherche d'un ingénieur pratique, compétent et curieux qui aime construire de nouveaux outils et qui est intéressé à les utiliser pour répondre à des questions scientifiques fondamentales. Les candidats idéaux sont titulaires d'un diplôme de maîtrise en bioingénierie, en génie mécanique, en mécatronique, en génie électrique, en génie environnemental, en physique ou dans une discipline connexe, et possèdent certaines (pas nécessairement toutes) des compétences suivantes :

• Expérience pratique en prototypage et fabrication, par exemple CAD, impression 3D, usinage (fortement préféré).
• Expérience des systèmes de commande et de l'instrumentation, par exemple le contrôle moteur, les capteurs, les microcontrôleurs et le code d'automatisation ou d'acquisition de données (Python, MATLAB, LabVIEW ou similaire) (préféré).
• Ouverture pour acquérir de l'expérience dans le laboratoire de microbiologie : cultures bactériennes, technique stérile, lecteurs de plaques et cytométrie en flux.
• Familiarité avec la microscopie, l'analyse d'image, la mécanique des fluides ou la microfluidique (bienfaisante mais non nécessaire).
• La maîtrise de l'anglais (oral et écrit), l'enthousiasme pour travailler dans une équipe interdisciplinaire et internationale et la recherche de l'excellence scientifique (obligatoire).

Vous serez guidé par Prof. Roman Stocker et par des membres de son laboratoire ayant une vaste expérience en microbiologie, techniques expérimentales et processus environnementaux. Vous aurez l'occasion de travailler dans un environnement de recherche à la fine pointe de la technologie, d'interagir avec des chercheurs de diverses disciplines (ingénieurs, physiciens, microbiologistes, océanographes, chimistes, mathématiciens), d'acquérir une expérience technique dans diverses approches de recherche et d'interagir avec des collaborateurs de calibre mondial.

Nous offrons

ETH Zurich est un employeur favorable à la famille avec d'excellentes conditions de travail. Vous pouvez vous attendre à un environnement de travail passionnant, la diversité culturelle et des offres et des avantages attrayants.

Nous apprécions la diversité et la durabilité

Conformément à nos valeurs , ETH Zurich encourage une culture inclusive. Nous favorisons l'égalité des chances, valorisons la diversité et favorisons un environnement de travail et d'apprentissage dans lequel les droits et la dignité de tous nos employés et étudiants sont respectés. Visitez notre site Web sur l'égalité des chances et la diversité pour découvrir comment nous garantissons un environnement équitable et ouvert qui permet à chacun de grandir et de prospérer. La durabilité est une valeur fondamentale pour nous – nous travaillons constamment vers un avenir neutre sur le plan climatique.

Curieux ? Nous aussi.

Nous avons hâte de recevoir votre demande en ligne d'ici le 15 décembre 2026, y compris les documents suivants :

• Biographie
• Lettre de présentation (max. une page, y compris une brève motivation, des intérêts de recherche et une date de début possible)
• Transcription complète des études de premier cycle (bachelor et maîtrise, y compris les notes)
• Copie de la thèse de maîtrise ou de baccalauréat (PDF)
• Au moins deux lettres de référence

De plus amples informations sur The Stocker Lab sont disponibles sur notre site web. Les questions concernant le poste doivent être adressées au Dr Stefano Ugolini, [email protected] (aucune demande).

Les demandes seront examinées au fur et à mesure qu'elles seront reçues.

Veuillez noter que nous acceptons exclusivement les demandes soumises par notre portail en ligne. Les demandes par courriel ou par la poste ne seront pas prises en considération.

Nous tenons à souligner que la présélection est effectuée par les recruteurs responsables et non par l'intelligence artificielle.

A propos de l'ETH Zürich

ETH Zurich est l'une des plus grandes universités du monde spécialisées dans la science et la technologie. Nous sommes réputés pour notre excellente éducation, recherche fondamentale de pointe et transfert direct de nouvelles connaissances dans la société. Plus de 30 000 personnes de plus de 120 pays trouvent notre l'université d'être un lieu qui favorise la pensée indépendante et un environnement qui inspire l'excellence. Situé au cœur de l'Europe, mais forgeant des liens partout dans le monde, nous travaillons ensemble pour développer des solutions aux défis mondiaux d'aujourd'hui et de demain.

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