Computational Chemist - Generative Molecule & Protein Design — Roche

Description complète

Chez Roche vous pouvez vous montrer comme vous-même, embrassé pour les qualités uniques que vous apportez. Notre culture encourage l'expression personnelle, le dialogue ouvert et les liens authentiques, où vous êtes apprécié, accepté et respecté pour qui vous êtes, vous permettant de prospérer à la fois personnellement et professionnellement. C'est ainsi que nous visons à prévenir, à arrêter et à guérir les maladies et à garantir que chacun ait accès aux soins de santé aujourd'hui et pour les générations à venir. Rejoignez Roche, où chaque voix compte.

La position

Un avenir plus sain. C'est ce qui nous pousse à innover. Faire progresser continuellement la science et veiller à ce que chacun ait accès aux soins dont il a besoin aujourd'hui et pour les générations à venir. Créer un monde où nous avons tous plus de temps avec les gens que nous aimons. C'est ce qui fait de nous Roche. Chez Roche Sequencing Solutions, nous construisons la prochaine génération de plateformes de séquençage et de diagnostic alimentées par un calcul avancé et l'IA. Dans le cadre de notre chapitre sur la science et l'informatique, vous serez à l'intersection de la chimie computationnelle, de la biologie structurale et de l'IA appliquée pour avoir un impact direct sur les instruments commerciaux et les flux de travail en R-D.

L'opportunité Vous rejoindrez un environnement innovant et collaboratif où vous pourrez :

• Conduire la conception moléculaire et protéique : construire et exécuter des flux de travail virtuels de dépistage basés sur la structure et le ligand pour trouver de nouveaux substrats, cofacteurs et petites molécules pour nos plateformes de séquençage et de biocatalyse.
• Modélisation enzymatique & De Novo Design: Effectuez des simulations avancées de modélisation structurale et d'arrimage moléculaire sur des variantes enzymatiques naturelles et artificielles, en mettant l'accent sur l'optimisation des voies de liaison multiligands. Le plomb dans la conception d'enzymes de silico de novo, créant de nouveaux échafaudages protéiques et des sites actifs adaptés pour la liaison multi-ligands, la catalyse optimale et une stabilité structurelle accrue.
• Simuler la dynamique moléculaire : Explorez les changements conformationnels, les mécanismes de réaction, les états de transition et les structures électroniques à l'aide d'outils avancés de modélisation physique et de chimie quantique.
• Utiliser des outils de calcul : Analyser et optimiser les biopolymères et les polymères biomimétiques, en tirant parti de riches ensembles de données internes pour concevoir de nouveaux dérivés et des propriétés d'accord pertinentes au séquençage et aux performances diagnostiques.
• Advance Generative AI Pipelines: Développez et étalonnez les workflows générateurs (y compris les transformateurs, les GNN et les modèles de diffusion) pour la génération de molécules guidées par la propriété et la planification de synthèse assistée par ordinateur (CASC).
• Collaborer étroitement avec des biochimistes expérimentaux en laboratoire humide, des ingénieurs en protéines et des chimistes synthétiques afin de transformer les connaissances informatiques en expériences réelles.
• Technologies émergentes pilotes : Scout et mise en œuvre d'outils de pointe de la littérature et de l'écosystème dynamique local de l'IA dans les workflows de production.

Qui vous êtes Vous êtes un scientifique curieux, collaboratif et motivé qui aime combiner la modélisation basée sur la physique avec l'apprentissage machine moderne pour résoudre des énigmes biologiques complexes. Vous expliquez clairement les modèles complexes à diverses équipes, valorisez la recherche reproductible, et êtes heureux de co-concevoir des expériences qui relient les mondes numérique et physique.

• Vous avez un doctorat en chimie computationnelle, en biochimie, en biophysique, en biologie structurale, ou un domaine connexe hautement quantitatif ou un master en chimie computationnelle, en biochimie avec 2 ans d'expérience connexe ou des baccalauréats avec 3 ans d'expérience connexe.
• Vous avez 1+ ans d'expérience de recherche intensive (académique ou industrielle) axée sur la modélisation protéique, la conception moléculaire, le dépistage virtuel ou l'IA/ML pour les molécules.
• Vous avez une expérience pratique des outils d'arrimage, des paquets de dynamique moléculaire (comme GROMACS, AMBER ou OpenMM) et des outils de chimie quantique.
• Vous êtes compétent en Python (NumPy, SciPy, Pandas, PyTorch) associé à une expérience pratique en utilisant RDKit pour la chimie et le développement de modèles moléculaires génériques.
• Vous avez une forte compréhension de la cinétique des enzymes, la thermodynamique de liaison, l'état de transition