Data scientist in diagnostic molecular pathology 80-100% — Universitätsspital Zürich (USZ)

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Vollständige Beschreibung

Die Abteilung Molekulare Pathologie am Institut für Pathologie und Molekulare Pathologie am Universitätsklinikum Zürich ist eine führende Einheit für Entwicklungen in der Präzisionsmedizin einschließlich Tumorgenomik und Multi-Omics-Datenintegration. Die diagnostischen Analysen umfassen zahlreiche moderne Omik-Methoden und Spitzentechnologien: Gesamtgenomsequenzierung, Bulk-RNA-Sequenzierung, Methylierungs-Array, digitale Pathologie, Panel-Sequenzierung. Unsere Wissenschaftler analysieren die Rohdaten dieser Assays, um Diagnoseberichte zu erstellen, neue Methoden zu entwickeln und Forschungsprojekte zu unterstützen.
Das Universitätsspital Zürich ist ein der jährlichen Spitäler in der Schweiz. Unsere über 8'600 Mitarbeitenden und rund 700 Ausbildungen setzen sich täglich für das Wohl unseres Patienten:innen ein. Aufgaben: • Unabhängige Analyse, Qualitätskontrolle und Interpretation von NGS- und Multi-Omics-Daten in einer Diagnoseumgebung • Entwicklung, Validierung und Implementierung von Bioinformatik-Pipelines für die molekulare Routinediagnostik • Immunogenomische Analysen mit klinisch relevanter Interpretation • Anwendung von maschinellem Lernen / KI-Methoden auf Omics-Daten mit Schwerpunkt auf Robustheit und Interpretierbarkeit • Übersetzung neuer Methoden in die Routinediagnostik, einschließlich Dokumentation und Validierung • Erstellung klinischer Berichte in Zusammenarbeit mit Pathologen und Molekularbiologen • Unterstützung bei der Ausbildung von medizinischem und Laborpersonal in Dateninterpretation und Bioinformatik-Workflows Anforderungen: • MSc oder PhD in Bioinformatik, Computational Biology, Medical Informatics oder einem verwandten Bereich • Starke Erfahrung in der NGS / Omics-Datenanalyse in einem angewandten Umfeld • Kenntnisse in Python und / oder R (Bioconductor) • Starkes Verständnis der Molekularbiologie und Genetik mit der Fähigkeit, Daten in einem biologischen und klinischen Kontext zu interpretieren • Solides Verständnis von Statistik und maschinellem Lernen • Erfahrung mit Workflow Management Systemen (Nextflow, Snakemake) und Containerisierung (Docker/Singularity) • Ausgezeichnete analytische, Kommunikations- und Schreibfähigkeiten • Englisch erforderlich, Deutsch ist von Vorteil Bevorzugte Qualifikationen: Erfahrung in der Krebsgenomik, Immunogenomik, Transkriptomik oder Epigenetik, Metagenomik, KI-basierte Bildanalyse, Datenmanagement / strukturierte Berichterstattung, integrative Multi-Omics oder Arbeit in einem klinischen / medizinischen Umfeld Wir bieten: Wir bieten eine interdisziplinäre Position, die die Interpretation und Berichterstattung von molekulardiagnostischen Big Data mit der klinischen Wissenschaft am Institut für Pathologie und Molekulare Pathologie des Universitätsklinikums Zürich in einem starken Kooperationsrahmen mit Experten anderer führender Schweizer Institutionen verbindet. In Zürich tauchen Sie in ein dynamisches, offenes und motivierendes wissenschaftliches und akademisches Umfeld ein. Wir werden durch intra- und extramurale Finanzierung unterstützt und sind an mehreren hoch sichtbaren nationalen und internationalen Kooperationen beteiligt.

Stellendetails

  • Unternehmen: Universitätsspital Zürich (USZ)
  • Position: Data scientist in diagnostic molecular pathology 80-100%
  • Standort: Campus, Tessin
  • Gehalt: CHF 73'500 - 111'500 (Quelle ungeprüft)
  • Branche: Sanità / Ospedali
  • Abgelaufen am: 2026-08-06

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