Technical Lead - Genome of Switzerland (GoS) — EPFL

Descrizione completa

Missione

Il Responsabile tecnico / Genomic Data Engineer è responsabile per la progettazione, l'implementazione, il funzionamento e il miglioramento continuo dell'infrastruttura tecnica che supporta il programma Genome of Switzerland. La posizione garantisce l'elaborazione efficiente, sicura e scalabile, la gestione e la consegna di dati genomici e risorse analitiche.

Principali doveri e responsabilità

• Definire e mantenere la roadmap tecnica che supporta il programma Genome of Switzerland.
• Sviluppare, mantenere e ottimizzare le pipeline genomiche di elaborazione dei dati e flussi di lavoro analitici.
• Assicurare l'ingestione sicura, l'archiviazione, l'organizzazione, la tracciabilità e la consegna dei set di dati genomici e dei metadati associati.
• Controllare le procedure di controllo della qualità durante la generazione dei dati e il flusso di lavoro di elaborazione.
• Contribuisci all'automazione, alla riproducibilità e alla scalabilità dei processi analitici e delle infrastrutture computazionali.
• Coordinare le interfacce tra piattaforme di sequenziamento, ambienti analitici, repository di dati e infrastrutture di condivisione dei dati.
• Sostenere l'integrazione, l'armonizzazione e la preparazione di dataset genomici per iniziative nazionali e internazionali, tra cui Genoma d'Europa e repository di accesso controllato.
• Contribuisci all'attuazione delle procedure di governance dei dati, sicurezza, controllo degli accessi e conformità.
• Mantenere la documentazione tecnica, le specifiche del flusso di lavoro e le procedure operative.
• Fornire competenze tecniche e supporto a scienziati di progetto, bioinformatica e istituzioni di collaborazione.
• Valutare, distribuire e mantenere tecnologie emergenti, strumenti software e infrastrutture computazionali rilevanti per la genomica su larga scala.
• Contribuisci alla reportistica tecnica, ai programmi e alle presentazioni degli stakeholder.

Profilo

• MSc o PhD in bioinformatica, biologia computazionale, informatica, ingegneria dei dati o un campo correlato.
• Progettazione, distribuzione e gestione di infrastrutture di elaborazione dati genomica o biomedica su larga scala.
• Forte capacità di programmazione (Python, Bash e/o linguaggi simili).
• Esperienza con ambienti Linux, sistemi di gestione del flusso di lavoro, tecnologie di containerizzazione e infrastrutture di calcolo cloud o ad alte prestazioni.
• Familiarità con formati di dati genomici, tecnologie di sequenziamento e flussi di analisi genomica.
• Esperienza di realizzazione di condotte analitiche riproducibili e automatizzate.
• Conoscenza dei principi di sicurezza, controllo degli accessi e governance dei dati.
• Forte capacità di problem solving, documentazione e comunicazione.
• Capacità di lavorare efficacemente in ambienti multidisciplinari e multi-istituzionali.
• La familiarità con il Genoma della Svizzera proietta un forte asset
• Ottimo comando dell'inglese; la conoscenza del francese è un bene.

Offriamo

• Un ambiente di lavoro stimolante e internazionale
• stipendio competitivo e condizioni di lavoro eccellenti

Informazioni

Data di inizio del contratto: appena possibile

Tasso di attività: 100.00

Tipo di contratto: CDI

Riferimento: 2369