PhD - Engineering a Microfluidic Platform for Next-Generation Live-seq — EPFL

Descrizione completa

Informazioni sul laboratorio e la vostra missione Deplancke Laboratorio di Sistemi Biologia e Genetica (EPFL) Il Laboratorio di Biologia dei Sistemi e Genetica, guidato dal Prof. Bart Deplancke, sta cercando uno studente di dottorato altamente motivato a contribuire allo sviluppo dello strumento Live-seq di nuova generazione, una piattaforma microfluidica avanzata che integra microfluidici droplet con microscopia di forza fluidica (FluidFM) per la biopsia monocellulare ad alto rendimento e transcriptomics live-cell. Live-seq si basa su FluidFM per estrarre quantità minime di liquido citoplasmico dalle cellule viventi per la sequenziazione del RNA ad alta sensibilità a valle, consentendo la profilazione transcriptome non distruttivo, spatio-temporale di singole cellule. Il vostro lavoro aiuterà la transizione Live-seq da un metodo a basso rendimento, dipendente dall'operatore in una tecnologia robusta, automatizzata, ad alto rendimento con applicazioni trasformative in biologia, medicina e scoperta della droga. Principali doveri e responsabilità Come studente di dottorato, ci si aspetta di:

• Abbiate piena responsabilità per la vostra dissertazione
• Ricerca in stretta collaborazione con partner industriali
• Progettazione sperimentale ed esecuzione
• Analizzare e interpretare i risultati sperimentali
• Scrivere articoli scientifici per la pubblicazione in riviste peer-reviewed
• Presente alle conferenze internazionali
• Partecipazione a progetti di istruzione e supervisione degli studenti Più specificamente, all'interno di questo progetto, si:
• Progettare, assemblare e ottimizzare un modulo microfluidico che integra microfluidici droplet picoliter con sonde nanofluidiche MEMS di nuova generazione per campionamento citoplasmico continuo utilizzando FluidFM.
• Integrare questo modulo micro-nanofluidico con sonde MEMS cantilever del laboratorio Fantner e con il sistema FluidFM semi-automatizzato, unità di controllo della pressione e fase automatizzata di campionamento sviluppato da Cytosurge, creando una piattaforma operativa senza soluzione di continuità.
• Eseguire test iterativi, risoluzione dei problemi e raffinatezza per fornire un prototipo robusto adatto per esperimenti biologici di routine.
• Condurre sperimentazioni di validazione temporale di Live-seq utilizzando un modello di differenziazione cellulare stabilito, il throughput di benchmarking, la qualità del transcriptome, la sensibilità e le prestazioni generali del sistema.
• Risultati di documenti, risultati presenti a collaboratori e contribuire a pubblicazioni scientifiche. Profilo
• Una laurea MSc
• Sfondo in bioingegneria, ingegneria meccanica o chimica, biofisica, microfluidics/nanofluidics, o una disciplina relativa.
• Forte motivazione a lavorare all'interfaccia di fluidicità, strumentazione, integrazione del sistema e biologia monocellulare all'avanguardia.
• L'esperienza precedente con micro o nanofluidici e sistemi di flusso a pressione è fortemente apprezzata.
• Organizzato, proattivo e confortevole lavorare sia in modo indipendente che in un team collaborativo.
• Entusiasmo, curiosità scientifica, desideroso di imparare, buone capacità organizzative, rigore nel lavoro sperimentale.
• Alto livello di motivazione per il lavoro di ricerca accademica.
• La fluidità in inglese è essenziale [francese / tedesco / italiano sarebbe un bene]. Offriamo
• Condizioni di lavoro eccellenti in un ambiente di ricerca multidisciplinare e di livello mondiale.
• Il coinvolgimento diretto nello sviluppo di una tecnologia single-cell trasformativa.
• Un ambiente collaborativo unico che spazia dal laboratorio Deplancke (pioneri di Live-seq), dal laboratorio Fantner (leader nell'ingegneria delle sonde MEMS) e dalla Cytosurge AG (sviluppi di FluidFM). Informazioni Il processo di selezione coinvolge più fasi, e candidati a breve elenco sarà richiesto di applicare al Dottoral Program in Biotecnologia e Bioingegneria (EDBB) per qualificarsi per un dottorato in EPFL. Si prega di controllare questa pagina per ulteriori informazioni sull'ammissione. Si prega di notare che questo è un processo di applicazione separato necessario per essere idonei a completare il dottorato in EPFL. La tua domanda dovrebbe contenere:
• Una lettera di motivazione
• Il tuo curriculum dettagliato
• Informazioni di contatto
• I nomi e le informazioni di contatto di 3 riferimenti disposti a scrivere