Bioinformatician – Single-Cell Omics in Vascular & Skeletal Muscle Biology — ETH Zürich
- Località
- Zurich
- Contratto
- fixed-term
- Pubblicato
- Ieri
Panoramica
Bioinformatician – Single-Cell Omics in Vascular & Skeletal Muscle Biology
100%, Zurich, fixed-term print Drucken
The Laboratory of Exercise and Health, headed by Prof.
- Bioinformatician – Single-Cell Omics in Vascular & Skeletal Muscle Biology
- 100%, Zurich, fixed-term print Drucken
- Specific responsibilities include:
- Design, execute, and interpret scRNAseq analyses of human (patient-derived) and mouse skeletal muscle samples, identifying and annotating cell (sub)populations.
Responsabilità principali
- Specific responsibilities include:
- Design, execute, and interpret scRNAseq analyses of human (patient-derived) and mouse skeletal muscle samples, identifying and annotating cell (sub)populations.
- Discuss and design follow-up wet lab experiments with colleagues.
- Integrate scRNAseq datasets with other omics information, including spatial transcriptomics, ATAC sequencing, metabolomics and/or multiplex imaging data.
- Perform cross-species (human–mouse) data integration to identify conserved and divergent cellular and molecular signatures of PAD.
Processo di candidatura
- and further develop computational tools for cell-cell communication analysis (ligand-receptor interactions and signaling pathways) and constraint based metabolic modeling tools (e.g.
- COMPASS, scFEA) to link transcriptional states to cell metabolism.
- Analyze single-cell datasets generated from in vivo cell-cell interaction tracing models.
- Perform pseudobulk and differential expression analyses (e.g. edgeR) of scRNAseq/5’ECCITE-seq data from CRISPR perturbation screens.
- in silico perturbation approaches to nominate candidate regulators of cellular crosstalk for downstream functional validation.
- Build, document, and maintain reproducible bioinformatics pipelines, and support other lab members with transcriptomics and genomics data.
- Designing Shiny apps for data visualization for internal and possibly external use in publications.
- Contribute to manuscript preparation, data visualization, and project reporting, and stay current with emerging single-cell and spatial genomics methods. Profile
Dettagli ulteriori
- 100%, Zurich, fixed-term
- Katrien De Bock at the Department of Health Sciences and Technology (D-HEST), ETH Zurich, is offering a fixed-term position for a bioinformatician (postdoctoral level) to lead the single-cell and spatial transcriptomics analyses within the laboratory of Exercise and Health. Project background
- For more information on the lab, visit www.musec.ethz.ch
- Apply and further develop computational tools for cell-cell communication analysis (ligand-receptor interactions and signaling pathways) and constraint based metabolic modeling tools (e.g.
- Apply in silico perturbation approaches to nominate candidate regulators of cellular crosstalk for downstream functional validation.
- Contribute to manuscript preparation, data visualization, and project reporting, and stay current with emerging single-cell and spatial genomics methods.
- A strong interest in skeletal muscle physiology and/or vascular biology; prior research exposure to these fields is a plus but not required. Good understanding of b
Note e contenuto originale
- Katrien De Bock at the Department of Health Sciences and Technology (D-HEST), ETH Zurich, is offering a fixed-term position for a bioinformatician (postdoctoral level) to lead the single-cell and spatial transcriptomics analyses within the laboratory of Exercise and Health.
- Project background
- Job description
- A strong interest in skeletal muscle physiology and/or vascular biology; prior research exposure to these fields is a plus but not required.
- Good understanding of b
Domande frequenti su questo annuncio
Che stipendio offre ETH Zürich per questa posizione?
ETH Zürich indica CHF 73'500 - 111'500 lordi annui per questo ruolo a Zurich. Questo è lo stipendio pubblicato nell'annuncio originale (o, quando il datore non specifica una cifra, una stima realistica per ruolo e settore) — il calcolatore di questo sito lo converte nel netto reale una volta applicate imposta da frontaliere e contributi sociali.
È un ruolo a tempo pieno, e che tipo di contratto offre ETH Zürich?
Questo annuncio è una posizione a contratto a tempo determinato. Il tipo di contratto mostrato qui arriva direttamente dall'annuncio originale del datore di lavoro; conferma sempre orario esatto, preavviso e durata del periodo di prova con ETH Zürich durante il colloquio, perché questi dettagli possono variare anche all'interno della stessa categoria contrattuale.
Serve un permesso da frontaliere per un ruolo nel canton Zurigo?
I residenti UE/AELS nella zona di frontiera del paese confinante con il canton Zurigo possono richiedere il Permesso G; il datore di lavoro svizzero lo presenta all'ufficio della migrazione di quel canton dopo la firma del contratto. Regole sulla zona di frontiera e tempi di lavorazione variano per paese confinante e canton — verifica i dettagli con l'ufficio della migrazione del canton Zurigo o con HR durante il colloquio.
Come mi candido a questa posizione presso ETH Zürich?
Usa il pulsante "Candidati ora" in questa pagina — rimanda direttamente all'annuncio originale di ETH Zürich su jobs.ethz.ch, quindi la tua candidatura arriva direttamente nel sistema di gestione candidature del datore di lavoro. Frontaliere Ticino non raccoglie né inoltra candidature in proprio.
