Data scientist in diagnostic molecular pathology 80-100% — Universitätsspital Zürich (USZ)

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Description complète

L'unité de pathologie moléculaire du Département de pathologie et de pathologie moléculaire de l'hôpital universitaire de Zurich est une unité de pointe pour les développements en médecine de précision, y compris la génomique tumorale et l'intégration de données multi-omiques. Les analyses diagnostiques comprennent de nombreuses méthodes omiques modernes et technologies de pointe: Séquence du génome entier, séquençage de l'ARN en vrac, tableau de méthylation, pathologie numérique, séquençage du panneau. Nos scientifiques analysent les données brutes de ces essais pour créer des rapports de diagnostic, élaborer de nouvelles méthodes et appuyer des projets de recherche.
Das Universitätsspital Zürich ist eines der grössten Spitäler in der Schweiz. Unsere über 8'600 Mitarbeitenden und rated 700 Auszubildende setzen sich täglich für das Wohl unserer Patient:innen ein. Aufgaben: • Analyse indépendante, contrôle de la qualité et interprétation des données NGS et multi-omiques dans un cadre de diagnostic • Élaboration, validation et mise en oeuvre de pipelines de bioinformatique pour le diagnostic moléculaire de routine • Analyses immunogéniques avec interprétation cliniquement pertinente • Application des méthodes d'apprentissage automatique/AI aux données omiques, en mettant l'accent sur la robustesse et l'interprétabilité • Traduction de nouvelles méthodes en diagnostics de routine, y compris documentation et validation • Préparation de rapports cliniques en collaboration avec des pathologistes et des biologistes moléculaires • Appui à la formation du personnel médical et de laboratoire aux processus d'interprétation des données et de bioinformatique - C'est pas vrai. • Maîtrise ou doctorat en bioinformatique, biologie informatique, informatique médicale ou domaine connexe • Forte expérience de l'analyse de données NGS/omique dans un contexte appliqué • Compétence en Python et/ou en R (bioconducteur) • Forte compréhension de la biologie moléculaire et de la génétique, avec la capacité d'interpréter les données dans un contexte biologique et clinique • Compréhension solide des statistiques et de l'apprentissage automatique • Expérience des systèmes de gestion des flux de travail (Nextflow, Snakemake) et de conteneurisation (Docker/Singularité) • Excellentes compétences en analyse, communication et écriture • Anglais requis, l'allemand est un avantage Qualifications privilégiées : expérience en génomique du cancer, immunogénomique, transcriptomique ou épigénétique, métagénomique, analyse d'image basée sur l'IA, gestion des données/rapport structuré, multiomique intégrative ou travail dans un environnement clinique/médical - Oui. Nous offrons une position interdisciplinaire reliant l'interprétation et le compte rendu des mégadonnées de diagnostic moléculaire aux sciences cliniques au Département de pathologie et de pathologie moléculaire de l'hôpital universitaire de Zurich dans un cadre de collaboration solide comprenant des experts d'autres institutions suisses de premier plan. A Zurich, vous serez immergés dans un environnement scientifique et académique dynamique, ouvert et motivant. Nous sommes soutenus par un financement intra et extra-muros et nous participons à plusieurs collaborations nationales et internationales de grande visibilité.

Détails de l'offre

  • Entreprise: Universitätsspital Zürich (USZ)
  • Poste: Data scientist in diagnostic molecular pathology 80-100%
  • Lieu: Campus, Tessin
  • Salaire: CHF 73'500 - 111'500 (source non vérifiée)
  • Secteur: Sanità / Ospedali
  • Expirée le: 2026-08-06

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