Principal Bioinformatics Scientist I — Roche

Description complète

Chez Roche vous pouvez vous montrer comme vous-même, embrassé pour les qualités uniques que vous apportez. Notre culture encourage l'expression personnelle, le dialogue ouvert et les liens authentiques, où vous êtes apprécié, accepté et respecté pour qui vous êtes, vous permettant de prospérer à la fois personnellement et professionnellement. C'est ainsi que nous visons à prévenir, à arrêter et à guérir les maladies et à veiller à ce que chacun ait accès aux soins de santé aujourd'hui et pour les générations à venir. Rejoignez Roche, où chaque voix compte.

La position

Chercheur principal en bioinformatique I

Ce rôle est un élément vital de notre équipe de bioinformatique, qui s'engage à faire progresser la médecine de précision en construisant des outils informatiques de pointe pour le diagnostic clinique. En tant que membre de cette équipe, vous vous retrouverez à l'intersection dynamique de la biologie computationnelle, du développement d'essais et de l'ingénierie logicielle pour traduire des données génomiques complexes en données de santé exploitables.

Vous aurez l'occasion de collaborer étroitement avec des partenaires interfonctionnels à travers Wet-Lab Assay Development, Software Engineering, CLIA Operations et Quality pour concevoir, valider et opérationnaliser des tests diagnostiques de nouvelle génération.

L'opportunité

En tant que chercheur en bioinformatique, vous dirigerez la conception, l'optimisation et la validation clinique de pipelines et d'algorithmes de traitement de données NGS innovants. Vous serez le pont technique entre l'innovation en labo humide et l'ingénierie logicielle de qualité de production, en tirant parti de la modélisation statistique avancée et des outils modernes de codage de l'IA pour fournir des diagnostics moléculaires à haute précision pour les soins aux patients.

• Pipeline & Algorithm Development: Conception, référence et optimiser les pipelines bioinformatiques NGS évolutives et reproductibles utilisant les environnements Nextflow, Docker/Singularity et Cloud.
• Validation analytique: Partenaire avec les équipes de développement d'Assay et de laboratoire CLIA pour établir des plans d'analyse statistique et valider de nouveaux tests diagnostiques (assurer une haute sensibilité, spécificité et précision).
• Ingénierie Accélérée par l'IA : Intégrez régulièrement des outils de codage de l'IA et des workflows automatisés pour accélérer le développement d'algorithmes, la refacturation et l'analyse des données.
• Traduction de la production: Ébauche de spécifications fonctionnelles et techniques claires pour guider les équipes de génie logiciel dans la transition des prototypes de recherche vers des logiciels cliniques robustes.
• Qualité et conformité à la réglementation : Mettre en oeuvre des mesures statistiques du CQ au niveau de l'échantillon et de l'exécution, tout en maintenant une documentation complète conforme au SGQ pour les vérifications de l'ACP et de l'ACIA.
• Pratiques exemplaires: Appliquer des pratiques d'ingénierie logicielle de haut niveau, y compris le contrôle des versions Git, l'intégration continue, les essais unitaires et l'architecture modulaire.

Qui vous êtes

• Études et expérience : Maîtrise avec plus de 7 ans d'expérience connexe; doctorat avec plus de 4 ans d'expérience connexe (l'expérience de travail peut être antérieure ou post-grade; une formation académique pertinente de laboratoire post-grade sera envisagée).
• Collaboration matricielle et gestion des intervenants : Capacité éprouvée de s'associer harmonieusement entre les équipes multidisciplinaires, y compris les scientifiques en laboratoire humide, les ingénieurs en logiciels, les directeurs de laboratoire et l'assurance de la qualité, afin d'aligner les spécifications techniques sur les objectifs cliniques.
• Expertise en diagnostic clinique : Expérience démontrée appuyant ou travaillant dans un environnement de laboratoire certifié CAP/CLIA ayant une expérience directe dans le développement de tests diagnostiques et la validation analytique.

Maîtrise technique

• Compréhension approfondie de l'analyse des données séquentielles à haut débit selon diverses modalités (panneaux ciblés, WGS/WES, transcriptomique, biopsie liquide/ADNct).
• Compétence en Python/R/C++ et Linux/Bash, avec expérience pratique en utilisant les gestionnaires de flux de travail (Nextflow) et les déploiements de logiciels conteneurisés.
• Modern Workflow Adaptabilité : Capacité éprouvée de tirer parti des outils de développement de l'IA pour maximiser la productivité, en plus d'excellentes compétences en communication adaptées à la navigation dans des environnements organisationnels complexes et interfonctionnels.

Les indemnités de réinstallation ne sont pas disponibles pour ce poste.

L'échelle salariale prévue pour ce poste