Laboratory Manager — ETH Zürich

Description complète

Directeur de laboratoire

100%, Bâle, durée déterminée

Le Laboratoire Quake est établi à l'ETH Zürich en 2026 par Stephen Quake, qui déménage de l'Université Stanford. Le laboratoire travaille à l'interface de la physique, de l'ingénierie et de la biologie, développant de nouvelles approches de mesure et de modélisation qui transforment ce qui est possible pour apprendre à partir de cellules individuelles et de quantités infimes de matériel moléculaire.

Trois grands programmes de recherche se dérouleront en parallèle : 1) reconstruire l'architecture réglementaire d'E. coli à haute résolution comme base de modèles prédictifs de régulation génique; 2) construire des atlas monocellulaires à grande échelle de tissus humains et d'organismes modèles - y compris un atlas premier de son genre du système nerveux autonome humain - et former des modèles d'IA/fondation sur ces atlas pour interroger la biologie du vieillissement et l'évolution de la multicellularité; et 3) faire progresser les approches de biopsie liquide qui lisent les acides nucléiques libres de cellules du sang pour détecter les maladies, surveiller la physiologie en collaboration avec des partenaires externes.

Le laboratoire sera un environnement multidisciplinaire d'une dizaine de personnes comprenant des biologistes moléculaires, des biochimistes, des biologistes computationnels, des chercheurs en apprentissage automatique, des physiciens et des ingénieurs, avec des collaborations actives dans l'ETH, l'EPFL, l'Université de Zurich et à l'échelle internationale.

Contexte du projet

Le gestionnaire de laboratoire est l'épine dorsale opérationnelle du groupe. Vous posséderez le fonctionnement quotidien d'un laboratoire humide complexe et multimodal — de la biologie moléculaire bactérienne au traitement d'échantillons cliniques humains en passant par le séquençage à haut débit — tout en servant de chercheur principal, de formateur et de conseiller de confiance auprès de l'IP sur tout ce qui maintient un groupe de recherche productif.

Ce rôle est idéal pour un chercheur expérimenté qui aime travailler sur plusieurs systèmes biologiques, construire des infrastructures, encadrer des collègues moins expérimentés et être fier de l'excellence opérationnelle. On ne s'attend pas à ce que vous conduisiez un programme de recherche indépendant distinct; vous allez plutôt permettre et accélérer tous les autres. En retour, vous serez un noyau, nommé contributeur sur la science ambitieuse, avec une voix véritable dans la façon dont le laboratoire est construit.

Description de l'emploi

Exploitation et infrastructure des laboratoires

• Diriger l'aménagement et l'exploitation continue des installations de bancs humides du laboratoire à l'ETH, y compris la sélection de l'équipement, l'installation, la qualification et les contrats d'entretien de routine
• Établir et entretenir des ressources partagées : salles de culture cellulaire, zones BSL-2, séquençage des zones prép, stockage de –80 °C et d'azote liquide, autoclaves, stocks communs de réactifs et calendriers des instruments
• Commande personnelle, relations avec les fournisseurs, gestion des stocks et organisation des stocks pour les consommables et les réactifs; négociation d'accords-cadres lorsque cela est utile
• Tenir à jour et vérifier les PNE de base, les systèmes de suivi des échantillons et les pratiques des carnets de laboratoire électroniques dans l'ensemble du groupe
• Servir d'interface du laboratoire avec les installations de base de l'ETH (p. ex., Centre de génomique fonctionnelle Zurich, ScopeM, Genome Engineering & Measurement Lab) et les fournisseurs de services externes

Biologie moléculaire bactérienne et biochimie — E. coli regulome

• Exécuter et superviser un pipeline de clonage moléculaire pour E. coli — conception et assemblage de plasmides et de constructions intégrées au génome, construction de souches et stockage
• Mettre en place et maintenir des flux de travail biochimiques pertinents pour les études réglementaires : expression et purification des protéines, transcription in vitro et biochimie quantitative selon les besoins des projets
• Établir une infrastructure de croissance microbienne, d'induction et de parcours temporel, y compris des lecteurs de plaques, des systèmes de culture continue et des interfaces microfluidiques le cas échéant.
• Former de nouveaux membres de laboratoire en microbiologie fondamentale, technique stérile et génétique standard d'E. coli; dépanner des projets de clonage et d'expression bloqués

Biologie cellulaire des mammifères et manipulation des tissus — atlas monocellulaires

• Exécuter et superviser la culture cellulaire des mammifères (cellules primaires, cellules dérivées de l'iPSC, lignées établies), y compris la préparation des médias, l'authentification des lignées et la biobanque
• Établir des flux de travail robustes pour la dissociation des tissus, la préparation de suspension monocellulaire et mononucléique, le tri des cellules à base de FACS et l'évaluation de la qualité
• Coordonner le pipeline d'acquisition de tissus avec les partenaires cliniques et universitaires – accords de biospécimen, documentation sur la chaîne de garde, logistique de fixation et d'expédition, manipulation d'échantillons approuvée par l'éthique

Procédés de biopsie liquide et d'acide nucléique sans cellules

• Utiliser et maintenir des flux de travail d'extraction cfADN et cfRNA à faible entrée
• Mettre en oeuvre et affiner les protocoles de préparation de la bibliothèque de l'ARNc (GTS à petite entrée, méthylation/séq-EM, fragmentomique, panneaux ciblés, ARNc-séq-cf) et contribuer à l'élaboration de méthodes pour de nouvelles modalités d'essai
• Établir des pratiques de gestion de la qualité appropriées aux échantillons de qualité clinique

Séquence à haut débit

• Servir de praticien principal du laboratoire pour le séquençage des workflows — y compris la bibliothèque QC, la mise en commun, l'équilibrage et le fonctionnement des instruments ou la coordination des fournisseurs
• Établir des tableaux de bord et des critères d'acceptation du QC pour tous les types de bibliothèques (ARN-seq en vrac, ARN/ATAC monocellulaire, espace, ADNcf/ARNcf, microbien)
• Coordonner avec les membres de l'équipe de calcul sur les feuilles d'échantillonnage, le démultiplexage, le Qc primaire et le retour en temps opportun des FASTQ et des mesures standard
• Maintenir des relations avec le Centre de génomique fonctionnelle de Zurich et les fournisseurs de séquençage externes pour gérer les plates-formes de débordement et de spécialité

Personnes, formation et culture

• De nouveaux membres de laboratoire (postdocs, doctorants et étudiants en maîtrise, techniciens, visiteurs); concevoir et dispenser une formation pratique aux méthodes de base
• Mentor personnel de recherche junior et les étudiants de rotation au banc; diriger des réunions de laboratoire technique de routine et des cliniques de dépannage
• Favoriser une culture de laboratoire rigoureuse, collaborative et psychologiquement sûre; incarner et renforcer les attentes en matière de reproductibilité, de tenue de dossiers minutieuse et d'honnêteté intellectuelle

Conformité, sécurité et éthique

• Servir d'agent de biosécurité du laboratoire et de point de contact principal pour la sûreté, la sécurité, la santé et l'environnement (SGU); tenir à jour la documentation BSL-1/BSL-2, l'enregistrement des OGM et des agents pathogènes, selon le cas.
• Assurer le respect de la réglementation suisse relative à l'utilisation d'échantillons biologiques humains et de données personnelles (loi sur la recherche humaine, loi fédérale sur la protection des données), y compris les présentations et les modifications d'éthique
• Gérer l'inventaire chimique, les flux de déchets, la radioprotection (le cas échéant) et la documentation sur le travail des animaux en coordination avec les services vétérinaires de l'ETH
• Diriger les procédures de préparation d'urgence du laboratoire et servir de premier intervenant pour les incidents

Profil

Qualifications souhaitées

• Études : doctorat en biologie moléculaire, en biochimie, en bioingénierie, en génomique ou dans un domaine étroitement lié; ou maîtrise avec une expérience de recherche supplémentaire substantielle
• Expérience au banc : Au moins 5 ans d'expérience pratique après le diplôme dans un laboratoire de recherche, avec une expertise démontrée de niveau supérieur dans au moins deux des trois domaines principaux (biologie moléculaire bactérienne / génomique monocellulaire de mammifères / flux de travail sans cellules d'acide nucléique)
• Closonnage bactérien et biochimie : Expérience indépendante de conception et d'exécution du clonage d'E. coli, de l'ingénierie des souches et de la biochimie des protéines sans supervision
• Biologie des cellules de mammifères : Fluence dans la manipulation des cellules de mammifères primaires et cultivées, FACS et dissociation tissulaire pour la génomique monocellulaire
• Séquençage: Expérience directe de préparation et de QC'ing bibliothèques pour le séquençage Illumina; la connaissance d'au moins une plate-forme de lecture longue (ONT ou PacBio) est un avantage important
• Biopsie liquide / cfNA: Expérience démontrée de traitement du sang pour les acides nucléiques sans cellules et les soins préanalytiques nécessaires
• Leadership de laboratoire : suivi de la formation et supervision d'un plus grand nombre de scientifiques subalternes; capacité d'écrire des SOP claires et d'exécuter une opération interfonctionnelle
• Compétence opérationnelle: Confortable avec les budgets, les systèmes de commande, les contrats de service d'équipement et la documentation sur la biosécurité
• Communication : Excellente anglais écrit et parlé; capacité d'interagir efficacement avec les cliniciens, les fournisseurs, l'administration de l'ETH et les collaborateurs externes

Qualifications privilégiées

• Expérience des plates-formes génomiques monocellulaires (10x Génomique, Parse, Scale, Honeycomb) et transcriptomique spatiale
• Expérience des flux de travail d'échantillons cliniques ou biobancaires selon la norme ISO 15189 / ISO 20387 ou des systèmes de qualité équivalents
• Expérience avec l'administration suisse de la recherche, les systèmes ETH ou des institutions européennes comparables
• Compétences linguistiques en allemand

Nous offrons

• Une position de premier plan, intellectuellement centrale, dans l'un des groupes de recherche monocellulaire et de mesure les plus productifs au monde, alors qu'elle passe de Stanford à l'ETH
• Salaires et avantages sociaux concurrentiels en fonction de l'expérience et des lignes directrices en matière de STE
• Un horizon pluriannuel : il s'agit d'un rôle à long terme et non d'un tremplin
• Influence importante sur la conception des laboratoires, la sélection des équipements et les normes opérationnelles
• Co-auteurs sur les publications auxquelles vous contribuez matériellement, conformément à la pratique établie
• Appui au perfectionnement professionnel, y compris les voyages en conférence et la formation technique
• Soutien à la réinstallation des candidats qui déménagent à Bâle, conformément à la politique ETH
• Bâle : une ville exceptionnelle pour la science, l'industrie et la vie en dehors du laboratoire

Nous apprécions la diversité et la durabilité

Conformément à nos valeurs, ETH Zurich encourage une culture inclusive. Nous favorisons l'égalité des chances, valorisons la diversité et favorisons un environnement de travail et d'apprentissage dans lequel les droits et la dignité de tous nos employés et étudiants sont respectés. Visitez notre site Web sur l'égalité des chances et la diversité pour découvrir comment nous garantissons un environnement équitable et ouvert qui permet à tous de grandir et de prospérer. La durabilité est une valeur fondamentale pour nous – nous travaillons constamment vers un avenir neutre sur le plan climatique.

Curieux ? Nous aussi.

Nous sommes impatients de recevoir votre demande en ligne avec les documents suivants en format PDF :

• Une lettre de présentation décrivant votre expérience spécifique dans les trois domaines techniques de base et votre motivation pour un rôle de gestionnaire de laboratoire
• Un CV complet comprenant une liste de techniques dans lesquelles vous êtes un opérateur indépendant par rapport à celles dans lesquelles vous avez une familiarité de travail
• Noms et coordonnées de trois références professionnelles, dont au moins une vous a supervisé directement au cours des cinq dernières années

De plus amples renseignements sur notre département sont disponibles sur notre site Web. Les questions concernant le poste doivent être adressées au Prof. Stephen Quake, [email protected] (aucune demande).

Veuillez noter que nous acceptons exclusivement les demandes soumises par notre portail en ligne. Les demandes par courriel ou par la poste ne seront pas prises en considération.

Les demandes seront examinées en continu jusqu'à ce que le poste soit pourvu.

Nous tenons à souligner que la présélection est effectuée par les recruteurs responsables et non par l'intelligence artificielle.

À propos d'ETH Zürich

ETH Zurich est l'une des principales universités du monde spécialisées dans science et technologie. Nous sommes réputés pour notre excellente éducation, recherche fondamentale de pointe et transfert direct de nouvelles connaissances dans la société. Plus de 30 000 personnes de plus de 120 pays trouvent notre l'université d'être un lieu qui favorise la pensée indépendante et un un environnement qui inspire l'excellence. Situé au cœur de l'Europe, Nous travaillons ensemble pour développer des solutions aux défis mondiaux d'aujourd'hui et de demain.