Bioinformatician – Single-Cell Omics in Vascular & Skeletal Muscle Biology — ETH Zürich
- Lieu
- Zurich
- Contrat
- fixed-term
- Publié
- Hier
Vue d’ensemble du poste
Bioinformatician – Single-Cell Omics in Vascular & Skeletal Muscle Biology
100%, Zurich, fixed-term print Drucken
The Laboratory of Exercise and Health, headed by Prof.
- Bioinformatician – Single-Cell Omics in Vascular & Skeletal Muscle Biology
- 100%, Zurich, fixed-term print Drucken
- Specific responsibilities include:
- Design, execute, and interpret scRNAseq analyses of human (patient-derived) and mouse skeletal muscle samples, identifying and annotating cell (sub)populations.
Responsabilités principales
- Specific responsibilities include:
- Design, execute, and interpret scRNAseq analyses of human (patient-derived) and mouse skeletal muscle samples, identifying and annotating cell (sub)populations.
- Discuss and design follow-up wet lab experiments with colleagues.
- Integrate scRNAseq datasets with other omics information, including spatial transcriptomics, ATAC sequencing, metabolomics and/or multiplex imaging data.
- Perform cross-species (human–mouse) data integration to identify conserved and divergent cellular and molecular signatures of PAD.
Processus de candidature
- and further develop computational tools for cell-cell communication analysis (ligand-receptor interactions and signaling pathways) and constraint based metabolic modeling tools (e.g.
- COMPASS, scFEA) to link transcriptional states to cell metabolism.
- Analyze single-cell datasets generated from in vivo cell-cell interaction tracing models.
- Perform pseudobulk and differential expression analyses (e.g. edgeR) of scRNAseq/5’ECCITE-seq data from CRISPR perturbation screens.
- in silico perturbation approaches to nominate candidate regulators of cellular crosstalk for downstream functional validation.
- Build, document, and maintain reproducible bioinformatics pipelines, and support other lab members with transcriptomics and genomics data.
- Designing Shiny apps for data visualization for internal and possibly external use in publications.
- Contribute to manuscript preparation, data visualization, and project reporting, and stay current with emerging single-cell and spatial genomics methods. Profile
Détails supplémentaires
- 100%, Zurich, fixed-term
- Katrien De Bock at the Department of Health Sciences and Technology (D-HEST), ETH Zurich, is offering a fixed-term position for a bioinformatician (postdoctoral level) to lead the single-cell and spatial transcriptomics analyses within the laboratory of Exercise and Health. Project background
- For more information on the lab, visit www.musec.ethz.ch
- Apply and further develop computational tools for cell-cell communication analysis (ligand-receptor interactions and signaling pathways) and constraint based metabolic modeling tools (e.g.
- Apply in silico perturbation approaches to nominate candidate regulators of cellular crosstalk for downstream functional validation.
- Contribute to manuscript preparation, data visualization, and project reporting, and stay current with emerging single-cell and spatial genomics methods.
- A strong interest in skeletal muscle physiology and/or vascular biology; prior research exposure to these fields is a plus but not required. Good understanding of b
Notes et contenu original
- Katrien De Bock at the Department of Health Sciences and Technology (D-HEST), ETH Zurich, is offering a fixed-term position for a bioinformatician (postdoctoral level) to lead the single-cell and spatial transcriptomics analyses within the laboratory of Exercise and Health.
- Project background
- Job description
- A strong interest in skeletal muscle physiology and/or vascular biology; prior research exposure to these fields is a plus but not required.
- Good understanding of b
Questions sur cette offre
Quel salaire propose ETH Zürich pour ce poste ?
ETH Zürich indique CHF 73 500 - 111 500 bruts par an pour ce poste à Zurich. Il s'agit du salaire publié dans l'annonce d'origine (ou, si l'employeur ne précise pas de montant, d'une estimation réaliste pour le rôle et le secteur) — le calculateur de ce site le convertit en net réel une fois l'impôt frontalier et les cotisations sociales appliqués.
Est-ce un poste à temps plein, et quel type de contrat propose ETH Zürich ?
Cette offre est un poste en contrat à durée déterminée. Le type de contrat affiché ici provient directement de l'annonce originale de l'employeur ; confirmez toujours les horaires exacts, le préavis et la durée d'essai avec ETH Zürich pendant le processus de candidature, ces détails pouvant varier même au sein de la même catégorie de contrat.
Ai-je besoin d'un permis de frontalier pour un poste dans le canton de Zurich ?
Les résidents UE/AELE domiciliés dans la zone frontalière du pays voisin du canton de Zurich peuvent demander un permis G ; l'employeur suisse le dépose auprès de l'office cantonal des migrations après signature du contrat. Les règles de zone frontalière et les délais varient selon le pays voisin et le canton — confirmez les détails auprès de l'office des migrations du canton de Zurich ou avec les RH pendant la candidature.
Comment postuler à ce poste chez ETH Zürich ?
Utilisez le bouton « Postuler maintenant » sur cette page — il renvoie directement à l'annonce originale de ETH Zürich sur jobs.ethz.ch, votre candidature arrive donc directement dans le système de suivi des candidatures de l'employeur. Frontaliere Ticino ne collecte ni ne transmet lui-même les candidatures.
