Laboratory Manager — ETH Zürich

Vollständige Beschreibung

Laborleiter

100%, Basel, befristet

Das Quake Laboratory wird 2026 von Stephen Quake, der von der Stanford University umzieht, an der ETH Zürich gegründet. Das Labor arbeitet an der Schnittstelle von Physik, Technik und Biologie und entwickelt neue Mess- und Modellierungsansätze, die das Lernen von einzelnen Zellen und winzigen Mengen an molekularem Material verändern.

Drei große Forschungsprogramme werden parallel laufen: (1) die Regulierungsarchitektur von E. coli in hoher Auflösung als Grundlage für prädiktive Modelle der Genregulation zu rekonstruieren; (2) den Aufbau groß angelegter Einzelzellatlanten von menschlichem und Modellorganismusgewebe - einschließlich eines ersten Atlas des menschlichen autonomen Nervensystems - und das Training von AI / Grundlagenmodellen auf diesen Atlanten, um die Alterungsbiologie und die Evolution der Multizellularität zu hinterfragen; und (3) Flüssigbiopsieansätze voranzutreiben, die zellfreie Nukleinsäuren aus Blut lesen, um Krankheiten zu erkennen, die Physiologie in Zusammenarbeit mit externen Partnern zu überwachen.

Das Labor wird ein multidisziplinäres Umfeld von etwa 10 Personen sein, das Molekularbiologen, Biochemiker, Computerbiologen, Machine-Learning-Forscher, Physiker und Ingenieure umfasst, mit aktiven Kooperationen zwischen ETH, EPFL, der Universität Zürich und international.

Projekthintergrund

Der Laborleiter ist das operative Rückgrat der Gruppe. Sie werden das tägliche Funktionieren eines komplexen, multimodalen Nasslabors besitzen - von der bakteriellen Molekularbiologie über die Verarbeitung von menschlichen klinischen Proben durch Hochdurchsatz-Sequenzierung - und gleichzeitig als leitender Bankwissenschaftler, Trainer und vertrauenswürdiger Berater des PI für alles dienen, was eine produktive Forschungsgruppe am Laufen hält.

Diese Rolle ist ideal für einen erfahrenen Forscher, der gerne in mehreren biologischen Systemen arbeitet, Infrastruktur aufbaut, weniger erfahrene Kollegen betreut und stolz auf operative Exzellenz ist. Von Ihnen wird nicht erwartet, dass Sie ein separates unabhängiges Forschungsprogramm durchführen, sondern Sie werden es allen anderen ermöglichen und beschleunigen. Im Gegenzug werden Sie ein Kern sein, benannte Mitwirkende auf ehrgeizige Wissenschaft, mit einer echten Stimme in, wie das Labor gebaut wird.

Stellenbeschreibung

Laborbetrieb und Infrastruktur

• Leitung des Aufbaus und laufenden Betriebs der Wet-Bench-Einrichtungen des Labors an der ETH, einschließlich Geräteauswahl, Installation, Qualifizierung und routinemäßiger Wartungsverträge
• Aufbau und Pflege gemeinsamer Ressourcen: Zellkulturräume, BSL-2-Gebiete, Sequenzierungsvorbereitungszonen, -80 °C und Lagerung von Flüssig-Stickstoff, Autoklaven, gemeinsame Reagenzienbestände und Instrumentenkalender
• Eigene Bestellung, Lieferantenbeziehungen, Lagerverwaltung und Lagerorganisation über Verbrauchsmaterialien und Reagenzien
• Aushandeln von Rahmenverträgen, wo nützlich
• Pflegen und prüfen Sie Kern-SOPs, Sample-Tracking-Systeme und elektronische Labor-Notebook-Praktiken in der gesamten Gruppe
• Als Schnittstelle des Labors zu ETH-Kernanlagen (z.B. Functional Genomics Center Zürich, ScopeM, Genome Engineering & Measurement Lab) und externen Dienstleistern

Bakterielle Molekularbiologie und Biochemie — E. coli regulome

• Führen und Beaufsichtigen einer molekularen Klonierungspipeline für E. coli - Design und Montage von Plasmiden und genomintegrierten Konstrukten, Stammaufbau und Lagerung
• Aufbau und Pflege biochemischer Arbeitsabläufe, die für regulatorische Studien relevant sind: Proteinexpression und -reinigung, In-vitro-Transkription und quantitative Biochemie, je nach Projektanforderung
• Einrichtung einer mikrobiellen Wachstums-, Induktions- und Zeitverlaufsinfrastruktur, einschließlich Plattenleser, kontinuierlicher Kultursysteme und gegebenenfalls Mikrofluidik-Schnittstellen
• Trainieren Sie neue Labormitglieder in grundlegender Mikrobiologie, Steriltechnik und Standard-E. coli-Genetik
• Fehlersuche für Klonierung und Expression

Säugetierzellbiologie und Gewebehandhabung — Einzelzellatlanten

• Führen und überwachen Sie die Zellkultur von Säugetieren (Primärzellen, iPSC-abgeleitete Zellen, etablierte Linien), einschließlich Medienvorbereitung, Linienauthentifizierung und Biobanking
• Etablieren Sie robuste Workflows für die Gewebedissoziation, Vorbereitung auf Einzelzellen- und Einzelkernsuspensionen, FACS-basierte Zellsortierung und Qualitätsbewertung
• Koordination der Gewebeerfassungspipeline mit klinischen und akademischen Partnern — Biospecimen-Vereinbarungen, Dokumentation der Aufbewahrungskette, Fixierung und Versandlogistik, ethisch anerkanntes Probenhandling

Flüssigbiopsie und zellfreie Nukleinsäure-Workflows

• Betrieb und Pflege von cfDNA- und cfRNA-Extraktionsworkflows mit geringem Input
• Implementieren und verfeinern Sie die cfNA-Bibliothekspräparationsprotokolle (WGS mit geringem Input, Methylierung/EM-seq, Fragmentomik, Targeted Panels, cfRNA-seq) und tragen Sie zur Methodenentwicklung für neue Assaymodalitäten bei
• Festlegung von Qualitätsmanagementpraktiken für klinische Proben

Hochdurchsatzsequenzierung

• Als leitender Praktiker des Labors für die Sequenzierung von Workflows - einschließlich Bibliotheks-QC, Pooling, Balancing und Instrumentenbetrieb oder Anbieterkoordination
• Festlegung von QC-Dashboards und Akzeptanzkriterien über Bibliothekstypen hinweg (bulk RNA-seq, single-cell RNA/ATAC, spatial, cfDNA/cfRNA, microbial)
• Koordinieren Sie sich mit den Mitgliedern des Rechenteams bei Musterblättern, Demultiplexing, primärem QC und rechtzeitiger Rückgabe von FASTQs und Standardmetriken
• Pflegen Sie Beziehungen zum Functional Genomics Center Zürich und zu externen Sequenzierungsanbietern, um Overflow- und Spezialplattformen zu verwalten

Menschen, Ausbildung und Kultur

• An Bord neuer Labormitglieder (Postdocs, Doktoranden und MSc-Studenten, Techniker, Besucher); Design und praktisches Training in Kernmethoden
• Mentor Junior Research Staff und Rotationsstudenten an der Bank
• Leitung von routinemäßigen technischen Laborsitzungen und Fehlerbehebungskliniken
• Pflegen Sie eine strenge, kollaborative und psychologisch sichere Laborkultur; verkörpern und verstärken Sie Erwartungen in Bezug auf Reproduzierbarkeit, sorgfältige Aufzeichnung und intellektuelle Ehrlichkeit

Compliance, Sicherheit und Ethik

• Funktionieren Sie als Biosafety Officer des Labors und primärer Ansprechpartner für ETH Safety, Security, Health & Environment (SGU); pflegen Sie die BSL-1/BSL-2-Dokumentation, GVO- und Pathogenregistrierungen, soweit zutreffend
• Einhaltung der schweizerischen Vorschriften über die Verwendung von menschlichen biologischen Proben und personenbezogenen Daten (Humanforschungsgesetz, Bundesdatenschutzgesetz), einschließlich der Einreichung von Ethikvorschlägen und Änderungen
• Verwalten Sie Chemikalieninventar, Abfallströme, Strahlensicherheit (falls zutreffend) und Dokumentation der Tierarbeit in Abstimmung mit den Veterinärdiensten der ETH
• Führen Sie die Notfallvorsorgeverfahren des Labors und dienen Sie als Ersthelfer für Vorfälle

Profil

Gewünschte Qualifikationen

• Ausbildung: PhD in Molekularbiologie, Biochemie, Bioengineering, Genomik oder einem eng verwandten Bereich; oder ein Master-Abschluss mit erheblicher zusätzlicher Forschungserfahrung
• Bench-Erfahrung: Mindestens 5 Jahre praktische Erfahrung nach dem Abschluss in einem Forschungslabor mit nachweisbarem Fachwissen auf leitender Ebene in mindestens zwei der drei Kernbereiche (bakterielle Molekularbiologie / Einzelzellgenomik von Säugetieren / zellfreie Nukleinsäure-Workflows)
• Bakterielles Klonen und Biochemie: Unabhängige Erfahrung beim Entwerfen und Durchführen von E. coli Klonen, Stamm-Engineering und Protein-Biochemie ohne Aufsicht
• Säugetier-Zell-Biologie: Fluency in primären und kultivierten Säugetier-Zell-handling, FACS und Gewebe-Dissoziation für single-cell-genomics
• Sequenzierung: Direkte Erfahrung bei der Vorbereitung und QC'ing-Bibliotheken für die Illumina-Sequenzierung
• Vertrautheit mit mindestens einer Long-Read-Plattform (ONT oder PacBio) ist ein großer Vorteil
• Flüssigbiopsie / cfNA: Nachgewiesene Erfahrung bei der Blutverarbeitung für zellfreie Nukleinsäuren und die dafür erforderliche präanalytische Versorgung
• Laborleitung: Erfolgsbilanz bei der Ausbildung und Überwachung von mehr Nachwuchswissenschaftlern
• Fähigkeit, klare SOPs zu schreiben und eine funktionsübergreifende Bankoperation durchzuführen
• Betriebliche Kompetenz: Komfortabel mit Budgets, Bestellsystemen, Ausrüstungsserviceverträgen und Dokumentation der Biosicherheit
• Kommunikation: Ausgezeichnetes geschriebenes und gesprochenes Englisch
• Fähigkeit, effektiv mit Klinikern, Anbietern, ETH-Verwaltung und externen Mitarbeitern zu interagieren

Bevorzugte Qualifikationen

• Erfahrung mit einzelligen Genomikplattformen (10x Genomics, Parse, Scale, Honeycomb) und räumlicher Transkriptomik
• Erfahrung mit klinischen oder Biobank-Musterworkflows nach ISO 15189 / ISO 20387 oder gleichwertigen Qualitätssystemen
• Erfahrung mit Schweizer Forschungsverwaltung, ETH-Systemen oder vergleichbaren europäischen Institutionen
• Deutsch Sprachkenntnisse

Wir bieten

• Eine leitende, intellektuell zentrale Position in einer der produktivsten Einzelzellen- und Messwissenschaftsgruppen der Welt, wenn sie von Stanford an die ETH wechselt
• Wettbewerbsfähige ETH Gehalt und Leistungen, entsprechend der Erfahrung und ETH-Richtlinien
• Ein mehrjähriger Horizont: Dies ist als langfristige Rolle und nicht als Sprungbrett gedacht
• Wesentlicher Einfluss auf Labordesign, Geräteauswahl und Betriebsnormen
• Mitautorschaft bei Veröffentlichungen, zu denen Sie im Einklang mit der etablierten Praxis wesentlich beitragen
• Professionelle Entwicklungsunterstützung, einschließlich Konferenzreisen und technische Schulungen
• Relocation-Unterstützung für Kandidaten, die nach Basel ziehen, im Einklang mit der ETH-Politik
• Basel: eine außergewöhnliche Stadt für Wissenschaft, Wissenschaft angrenzende Industrie und das Leben außerhalb des Labors

Wir legen Wert auf Vielfalt und Nachhaltigkeit

Im Einklang mit unseren Werten fördert die ETH Zürich eine inklusive Kultur. Wir fördern Chancengleichheit, schätzen Vielfalt und fördern ein Arbeits- und Lernumfeld, in dem die Rechte und die Würde aller unserer Mitarbeiter und Studenten respektiert werden. Besuchen Sie unsere Website für Chancengleichheit und Vielfalt, um herauszufinden, wie wir ein faires und offenes Umfeld gewährleisten, in dem jeder wachsen und gedeihen kann. Nachhaltigkeit ist für uns ein zentraler Wert – wir arbeiten konsequent auf eine klimaneutrale Zukunft hin.

Neugierig? So sind wir.

Wir freuen uns auf Ihre Online-Bewerbung mit folgenden Dokumenten als PDF:

• Ein Anschreiben, das Ihre spezifischen Erfahrungen mit den drei technischen Kernbereichen und Ihre Motivation für eine Labormanagerrolle beschreibt
• Ein vollständiger Lebenslauf mit einer Liste von Techniken, in denen Sie ein unabhängiger Betreiber sind, im Vergleich zu denen, in denen Sie vertraut sind
• Namen und Kontaktdaten für drei professionelle Referenzen, von denen mindestens einer Sie in den letzten fünf Jahren direkt betreut hat

Weitere Informationen über unsere Abteilung finden Sie auf unserer Website. Fragen zur Stelle richten Sie bitte an Prof. Stephen Quake, [email protected] (keine Bewerbungen).

Bitte beachten Sie, dass wir ausschließlich Bewerbungen annehmen, die über unser Online-Bewerbungsportal eingereicht werden. Bewerbungen per E-Mail oder Post werden nicht berücksichtigt.

Anträge werden rollierend überprüft, bis die Position besetzt ist.

Wir weisen darauf hin, dass die Vorauswahl durch die verantwortlichen Recruiter und nicht durch künstliche Intelligenz erfolgt.

Über die ETH Zürich

Die ETH Zürich ist eine der weltweit führenden Universitäten, die sich auf Wissenschaft und Technologie. Wir sind bekannt für unsere hervorragende Ausbildung, Spitzenforschung und direkter Wissenstransfer in die Gesellschaft. Über 30.000 Menschen aus mehr als 120 Ländern finden unsere Universität ein Ort zu sein, der unabhängiges Denken und eine Umwelt, die Exzellenz inspiriert. Im Herzen Europas gelegen, Dennoch knüpfen wir Verbindungen auf der ganzen Welt, wir arbeiten zusammen, um Lösungen für die globalen Herausforderungen von heute und morgen zu entwickeln.