Research Software Engineer for Computational Mass Spectrometry — ETH Zürich

Descrizione completa

Ingegnere di software di ricerca per la spettrometria di massa computazionale

80%-100%, Zurigo, a tempo determinato

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Il Functional Genomics Center di Zurigo (FGCZ) è una struttura congiunta di ricerca e formazione all'avanguardia dell'ETH Zurigo e dell'Università di Zurigo. Con le più recenti tecnologie e le competenze chiave per la ricerca omica, la FGCZ fornisce servizi di ricerca e supporto di progetto alla comunità di ricerca scientifica sulla vita di Zurigo.

Siamo alla ricerca di un Ingegnere di Software di Ricerca presso il Functional Genomics Center di Zurigo il prima possibile o su accordo.

Sfondo del progetto

Questa posizione è concentrata sui dati di spettrometria di massa, con un focus primario sull'analisi e l'interpretazione della bioinformatica a sostegno dei ricercatori della FGCZ. In questo campo, il team copre l'elaborazione dei dati grezzi, l'elaborazione ad alte prestazioni, la valutazione statistica, l'interpretazione e l'analisi integrata. L'unità mantiene un portafoglio di applicazioni commerciali e open source operanti sulla nostra infrastruttura e stabilisce nuovi data processing e pipeline di analisi. Una parte integrante del lavoro sta integrando i dati nel nostro sistema di gestione dei dati e garantendo la riproducibilità dell'analisi.

Descrizione del lavoro

• Sosterrai la comunità degli utenti FGCZ proteomics e metabolomics mantenendo esistenti e sviluppando nuovi processi di elaborazione e analisi spettrometriche di massa
• In questo ruolo, applicherai le tue competenze in informatica e scienze dei dati per garantire la riproducibilità dell'analisi dei dati eseguita
• Come membro del gruppo di bioinformatica FGCZ, avrete compiti di back-office e user-desk per supportare i nostri collaboratori all'ETE e all'Università di Zurigo con i progetti di interpretazione e bioinformatica

Profilo

Competenze ed esperienze richieste

• Giocatore di squadra - lavorando a stretto contatto con scienziati bagnati e traducendo le loro esigenze in analisi
• Laurea accademica in una qualsiasi delle aree pertinenti, tra cui (ma non solo) informatica, statistiche o biologia
• Un master in un campo rilevante; i candidati con un Ph.D. sono ugualmente invitati ad applicare
• Proficienza nei sistemi operativi Microsoft Windows e Linux, comprese le interfacce di riga di comando
• Conoscenza pratica di almeno un linguaggio di programmazione (C++, C#, Java, Python) e strumenti come Git
• Uso responsabile e informato degli strumenti assistiti da AI in un contesto scientifico

Competenze e Esperienze Preferite

• Familiarità con la gestione e l'analisi dei set di dati su larga scala, in particolare i dati relativi agli omici
• Sfondo in bioinformatica, idealmente in spettrometria di massa
• Esperienza nelle discipline di imaging, spaziali o cross-omics
• Provato record di traccia di scrittura e mantenimento del codice
• Esperienza nella programmazione web R/Bioconductor e client
• Esperienza con il design UI/UX, in particolare lo sviluppo di interfacce web-based o desktop per la visualizzazione dei dati scientifici
• Esperienza con strumenti di virtualizzazione, ad esempio, Docker, Apptainer
• Esperienza con software di gestione delle risorse, ad esempio, Slurm

La capacità di lavorare indipendentemente è un prerequisito, così come la capacità di interagire efficacemente con il centro di ricerca e personale tecnico e gruppi di ricerca esterni in modo team-oriented La conoscenza avanzata dell'inglese è essenziale, in quanto questa è la lingua di lavoro del centro.

Incoraggiamo particolarmente le applicazioni dei candidati all'infanzia desiderosi di sviluppare le loro competenze in un ambiente di ricerca stimolante.

Luogo di lavoro

Offriamo

Una posizione molto interessante all'incrocio tra tecnologia e ricerca scientifica sulla vita. Le condizioni occupazionali sono conformi alle normative dell'ETH Zurigo e dell'Università di Zurigo. Lavorare alla FGCZ consente la collaborazione con il nostro gruppo internazionale multiculturale in un'atmosfera motivante, amichevole e flessibile. L'occupazione sarà presso l'ETH di Zurigo; la posizione è disponibile immediatamente.

chevron right Lavoro, insegnamento e ricerca presso l'ETH di Zurigo

Apprezziamo la diversità e la sostenibilità

In linea con i nostri valori