Data scientist in diagnostic molecular pathology 80-100% — Universitätsspital Zürich (USZ)

Descrizione completa

L'unità di Patologia Molecolare presso il Dipartimento di Patologia e Patologia Molecolare presso l'Ospedale Universitario di Zurigo, è un'unità leader per gli sviluppi in medicina di precisione tra cui la genomica tumorale e l'integrazione dei dati multi-omici. Le analisi diagnostiche includono numerosi omics-metodo moderni e tecnologie all'avanguardia: Sequenziamento del genoma intero, sequenziamento del RNA di massa, array di metilazione, patologia digitale, sequenziamento del pannello. I nostri scienziati analizzano i dati grezzi di questi saggi per creare report diagnostici, sviluppare nuovi metodi e sostenere progetti di ricerca. Das Universitätspital Zürich ist eines der grössten Spitäler in der Schweiz. Unsere über 8'600 Mitarbeitenden und rund 700 Auszubildende setzen sich täglich für das Wohl unserer Paziente:innen ein.

Aufgaben

• Analisi indipendente, controllo della qualità e interpretazione dei dati NGS e multi-omics in un ambiente diagnostico
• Sviluppo, convalida e implementazione di bioinformatica per la diagnostica molecolare di routine
• Analisi immunogenomica con interpretazione clinicamente rilevante
• Applicazione dei metodi di machine learning / AI per omicare i dati, con enfasi sulla robustezza e l'interpretabilità
• Traduzione di nuovi metodi nella diagnostica di routine, inclusa la documentazione e la convalida
• Preparazione di rapporti clinici in collaborazione con patologi e biologi molecolari
• Sostegno alla formazione di personale medico e di laboratorio nell'interpretazione dei dati e nei flussi di lavoro di bioinformatica

Anforderungen

• MSc o PhD in Bioinformatica, Biologia computazionale, Informatica medica, o un campo correlato
• Forte esperienza nell'analisi dei dati NGS/omics in un'impostazione applicata
• Proficienza in Python e/o R (Bioconduttore)
• Forte comprensione della biologia molecolare e della genetica, con la capacità di interpretare i dati in un contesto biologico e clinico
• Solida comprensione delle statistiche e dell'apprendimento automatico
• Esperienza con sistemi di gestione del flusso di lavoro (Nextflow, Snakemake) e containerizzazione (Docker/Singularity)
• Eccellente analitica, comunicazione e capacità di scrittura
• Inglese richiesto, Tedesco è un vantaggio

Qualità predeterminata: esperienza nella genomica del cancro, immunogenomica, trascrizione o epigenetica, metagenomica, analisi dell'immagine basata sull'intelligenza artificiale, gestione dei dati/relazione strutturata, multi-omica integrativa o lavoro in un ambiente clinico/medico

Wir bieten

Offriamo una posizione interdisciplinare che collega l'interpretazione e la segnalazione di grandi dati diagnostici molecolari con la scienza clinica presso il Dipartimento di Patologia e Patologia Molecolare, Ospedale Universitario di Zurigo in un quadro collaborativo forte, tra cui esperti in altre principali istituzioni svizzere. A Zurigo, sarete immersi in un ambiente dinamico, aperto e motivante scientifico e accademico. Siamo sostenuti da finanziamenti intra-e extra-strutturali e siamo coinvolti in diverse collaborazioni nazionali e internazionali ad alta visibilità.