Postdoctoral Researcher - Bioinformatics — ETH Zürich

Descrizione completa

Ricercatore post-dottorato

• Bioinformatica 100%, Zurigo, a tempo determinato stampa Druppo Il team Clinical Genomics guidato dal Dr. André Kahles presso il Biomedical Informatics Lab (BMI Lab), guidato dal Prof. Gunnar Rätsch, all'ETH di Zurigo, sta cercando un ricercatore postdoctoral altamente motivato con un forte background in bioinformatica, algoritmi e strutture dati. Il candidato di successo si unirà a uno sforzo interdisciplinare sviluppando tecnologie diagnostiche innovative basate su sequenziamento lungo e analisi di sequenza in tempo reale. Sfondo del progetto L'identificazione rapida e accurata delle infezioni batteriche rimane una grande sfida nella pratica clinica, in particolare nelle impostazioni di emergenza in cui la diagnosi ritardata può portare a trattamento suboptimale o ritardato e ad una maggiore mortalità in condizioni come la sepsi. I metodi diagnostici attuali spesso richiedono 24–72 ore, che possono contribuire all'uso empirico di antibiotici ad ampio spettro e all'emergere di resistenza antimicrobica. All'interno del consorzio RADIANT-Dx, il nostro team interdisciplinare sta sviluppando una piattaforma diagnostica portatile basata su un sequenziamento di lunga data per consentire una rapida profilazione transcriptomica delle risposte degli host e degli agenti patogeni direttamente dai campioni di sangue. Il progetto integra competenze sperimentali e computazionali per consentire l'analisi delle sequenze in tempo reale e fornire risultati clinicamente attuabili entro ore. Descrizione del lavoro
• svilupperai e implementerai nuovi metodi computazionali per l'analisi dei dati di sequenziamento lungo, tra cui analisi pre- e post-base-calling, per supportare lo sviluppo di una piattaforma diagnostica di nuova generazione
• Progetterai algoritmi e modelli statistici per l'analisi in tempo reale delle sequenze di dati transcriptomici host e patogeni, con un focus su approcci robusti e scalabili per applicazioni cliniche
• Si lavorerà a stretto contatto con un team interdisciplinare di bioinformatica, microbiologi, medici e ingegneri in tutta l'ETH di Zurigo, l'Università di Zurigo, e l'Ospedale Universitario di Zurigo
• Contribuirai all'integrazione dei metodi di bioinformatica in un progetto di ricerca traduttiva volto a consentire la diagnostica rapida e clinica delle malattie infettive
• Condurrai progetti di ricerca computazionale, pubblicherai risultati in importanti riviste scientifiche e contribuirai ad avanzare metodi in genomica microbica, analisi di sequenziamento a lungo termine e biologia computazionale applicata Profilo Si dovrebbe avere una laurea in:
• Biologia computazionale / Bioinformatica
• Scienza informatica
• Statistiche / Matematica applicata
• o un campo quantitativo correlato con un forte background in algoritmi, strutture di dati e modellazione statistica. L'esperienza nell'analisi delle sequenze, la genomica microbica e l'analisi dei dati di sequenziamento a lungo termine è altamente auspicabile. La familiarità con l'elaborazione del segnale o l'apprendimento automatico applicato è vantaggiosa. Si dovrebbe dimostrare una forte motivazione per sviluppare metodi computazionali innovativi e contribuire alla ricerca interdisciplinare con potenziale impatto clinico, idealmente supportato da un solido record di pubblicazione. Luogo di lavoro Luogo di lavoro Cosa?
• Il tuo lavoro con impatto: Diventa parte dell'ETH di Zurigo, che non solo supporta lo sviluppo professionale, ma contribuisce attivamente al cambiamento positivo nella società
• Ci si può aspettare numerosi vantaggi, come i biglietti per la stagione dei trasporti pubblici e la condivisione delle auto, una vasta gamma di sport offerti dalla ASVZ , l'assistenza all'infanzia e le interessanti prestazioni pensionistiche chevron right Lavoro, insegnamento e ricerca presso l'ETH di Zurigo Apprezziamo la diversità e la sostenibilità In linea con i nostri valori, ETH Zurich incoraggia una cultura inclusiva. Promuoviamo l'uguaglianza di opportunità, la diversità di valore e nutrire un ambiente di lavoro e di apprendimento in cui i diritti e la dignità di tutto il nostro staff e gli studenti sono rispettati. Visita il nostro sito web Equal Opportunities and Diversity per scoprire come garantiamo un ambiente equo e aperto che permetta a tutti di