Bioinformaticista – Omics monocellulari in Biologia muscolare vascolare e scheletale — ETH Zürich
- Località
- Zurich
- Contratto
- fixed-term
- Pubblicato
- 2 giorni fa
Panoramica
Bioinformaticista – Omics monocellulari in Biologia muscolare vascolare e scheletale
100%, Zurigo, a tempo determinato stampa Druppo
Il Laboratorio di Esercizio e Salute, guidato dal Prof.
- Bioinformaticista – Omics monocellulari in Biologia muscolare vascolare e scheletale
- 100%, Zurigo, a tempo determinato stampa Druppo
- Le responsabilità specifiche includono:
- Progettare, eseguire e interpretare le analisi scRNAseq di campioni muscolari scheletrico umano (paziente-derivato) e del topo, identificare e annotare le cellule (sotto)popolazioni.
- Laurea in bioinformatica, biologia computazionale, genomica computazionale, o un campo quantitativo relativo.
- Esperienza dimostrata pratica analizzando i dati di sequenziamento del RNA a singola cella (ad esempio Seurat, Scanpy) dall'elaborazione dei dati grezzi attraverso l'analisi a valle; l'esperienza con la trascrizione spaziale è un vantaggio forte.
Responsabilità principali
- Le responsabilità specifiche includono:
- Progettare, eseguire e interpretare le analisi scRNAseq di campioni muscolari scheletrico umano (paziente-derivato) e del topo, identificare e annotare le cellule (sotto)popolazioni.
- Discutere e progettare esperimenti di laboratorio bagnato follow-up con i colleghi.
- Integrare i dataset scRNAseq con altre informazioni omiche, tra cui la trascrizione spaziale, il sequenziamento ATAC, la metabolomica e/o i dati di imaging multiplex.
- Eseguire l'integrazione dei dati trasversali (umano-mouse) per identificare le firme cellulari e molecolari conservate e divergenti del PAD.
- Applicare e sviluppare ulteriormente gli strumenti computazionali per l'analisi della comunicazione cellulare (interazione con gli adattatori e le vie di segnalazione) e strumenti di modellazione metabolica basati sui vincoli (ad esempio COMPASS, scFEA) per collegare gli stati trascrizionali al metabolismo cellulare.
- Analizzare i set di dati a celle singole generati dai modelli di tracciamento dell'interazione cellulare in vivo.
- Eseguire analisi di espressione pseudobulk e differenziale (ad esempio edgeR) di dati scRNAseq/5’ECCITE-seq da schermi di perturbazione CRISPR.
- Applicare in silico perturbazione approcci per nominare i regolatori candidati di crosstalk cellulare per la validazione funzionale a valle.
- Costruire, documentare e mantenere oleodotti bioinformatici riproducibili e supportare altri membri del laboratorio con dati transcriptomici e genomici.
Requisiti principali
- Laurea in bioinformatica, biologia computazionale, genomica computazionale, o un campo quantitativo relativo.
- Esperienza dimostrata pratica analizzando i dati di sequenziamento del RNA a singola cella (ad esempio Seurat, Scanpy) dall'elaborazione dei dati grezzi attraverso l'analisi a valle; l'esperienza con la trascrizione spaziale è un vantaggio forte.
- Eccellente capacità di scrittura e analisi dei dati in R e/o Python, con una conoscenza approfondita dei relativi pacchetti Bioconductor/scverse.
- Forte esperienza con ambienti di sviluppo collaborativi (ad esempio GitHub/GitLab), controllo delle versioni e mantenimento di repository ben documentati e riutilizzabili.
- Esperienza di lavoro con ambienti di calcolo ad alte prestazioni.
- Un forte interesse per la fisiologia muscolare scheletrica e/o la biologia vascolare; l'esposizione preliminare di ricerca a questi campi è un plus ma non richiesto. Buona comprensione di b
Contatti
- Per ulteriori informazioni sul laboratorio, visitare il sito www.musec.ethz.ch
Dettagli ulteriori
- 100%, Zurigo, a tempo determinato
- Katrien De Bock presso il Dipartimento di Scienze della Salute e Tecnologia (D-HEST), ETH Zurich, sta offrendo una posizione a tempo determinato per un bioinformatico (livello postdoctoral) per condurre le analisi transcriptomiche monocellulari e spaziali all'interno del laboratorio di Esercizio e Salute. Sfondo del progetto
- Il laboratorio offre un ambiente di ricerca internazionale altamente collaborativo all'interfaccia di biologia vascolare, fisiologia muscolare e metabolismo. Descrizione del lavoro
- Un forte interesse per la fisiologia muscolare scheletrica e/o la biologia vascolare; l'esposizione preliminare di ricerca a questi campi è un plus ma non richiesto. Buona comprensione di b
Note e contenuto originale
- Katrien De Bock presso il Dipartimento di Scienze della Salute e Tecnologia (D-HEST), ETH Zurich, sta offrendo una posizione a tempo determinato per un bioinformatico (livello postdoctoral) per condurre le analisi transcriptomiche monocellulari e spaziali all'interno del laboratorio di Esercizio e Salute.
- Sfondo del progetto
- Il laboratorio offre un ambiente di ricerca internazionale altamente collaborativo all'interfaccia di biologia vascolare, fisiologia muscolare e metabolismo.
- Descrizione del lavoro
- Un forte interesse per la fisiologia muscolare scheletrica e/o la biologia vascolare; l'esposizione preliminare di ricerca a questi campi è un plus ma non richiesto.
- Buona comprensione di b
Domande frequenti su questo annuncio
Che stipendio offre ETH Zürich per questa posizione?
ETH Zürich indica CHF 73'500 - 111'500 lordi annui per questo ruolo a Zurich. Questo è lo stipendio pubblicato nell'annuncio originale (o, quando il datore non specifica una cifra, una stima realistica per ruolo e settore) — il calcolatore di questo sito lo converte nel netto reale una volta applicate imposta da frontaliere e contributi sociali.
È un ruolo a tempo pieno, e che tipo di contratto offre ETH Zürich?
Questo annuncio è una posizione a contratto a tempo determinato. Il tipo di contratto mostrato qui arriva direttamente dall'annuncio originale del datore di lavoro; conferma sempre orario esatto, preavviso e durata del periodo di prova con ETH Zürich durante il colloquio, perché questi dettagli possono variare anche all'interno della stessa categoria contrattuale.
Serve un permesso da frontaliere per un ruolo nel canton Zurigo?
I residenti UE/AELS nella zona di frontiera del paese confinante con il canton Zurigo possono richiedere il Permesso G; il datore di lavoro svizzero lo presenta all'ufficio della migrazione di quel canton dopo la firma del contratto. Regole sulla zona di frontiera e tempi di lavorazione variano per paese confinante e canton — verifica i dettagli con l'ufficio della migrazione del canton Zurigo o con HR durante il colloquio.
Come mi candido a questa posizione presso ETH Zürich?
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